Κύριοι στόχοι της έρευνας του τμήματος είναι:

• Η προαγωγή της ερευνητικής αριστείας
• Η καλλιέργεια νέων επιστημόνων υψηλού κύρους
• Η προαγωγή του τμήματος ως περιφερικό πόλο ανάπτυξης της έρευνας στις επιστήμες της φυσικής αγωγής, της άσκησης και του αθλητισμού στην γειτονική βαλκανική περιοχή.
• H συνεργασία με διεθνείς και εγχώριες επιχειρήσεις και η ανάπτυξη καινοτόμων προϊόντων και υπηρεσιών,